Instalação de software

Distribuições científicas da linguagem Python

A linguagem Python tem uma distribuição oficial que poderia ser obtida a partir do portal da linguagem www.python.org.

Para as aulas da UC de Bioquímica Computacional, em que se procura mostrar as vertentes de cálculo científico vetorial, capacidades gráficas e tratamento de dados estruturados em tabelas, são necessários módulos adicionais a instalar "sobre" a distribuição oficial.

Embora pudessem ser baixados dos respetivos sites, estes módulos adicionais já foram integrados em distribuições alternativas da linguagem Python orientados para o uso da linguagem em contextos de ciência ou de engenharia.

É de toda a conveniência que seja instalada uma destas distribuições "científicas". Existem várias, mas aconselhamos a distribuição Anaconda da empresa Anaconda Inc. Em alternativa, existe uma versão "lite" da distribuição Anaconda designada por Miniconda.

Instalação da distribuição Anaconda ou Miniconda

Anaconda (fortemente aconselhada):

Basta correr o instalador, que pode ser baixado a partir de:

https://www.anaconda.com/distribution/

Deve-se escolher a última versão do Python (3.7) e o instalador apropriado ao sistema operativo do computador (Windows, MacOS ou Linux).

A distribuição é "grande" (mais de 1 GB), aconselha-se a instalação "para o utilizador".

Miniconda (para os que têm problemas de falta de espaço em disco):

Obter e correr o instalador do Miniconda, que pode ser baixado a partir de :

https://conda.io/en/latest/miniconda.html

Deve-se escolher a última versão do Python (3.7) e o instalador apropriado ao sistema operativo do computador (Windows, MacOS ou Linux).

No final da instalação deve ser executado, numa linha de comando do sistema operativo:

conda install numpy sympy scipy matplotlib jupyter pandas